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目前没有直接证据能够证明打疫苗会使孩子的自闭症。
最早将儿童疫苗和孤独症扯上关系的是英国肠胃病学家安德鲁·韦克菲尔德，他的研究小组在1998《柳叶刀》发表了一篇论文，认为部分疫苗导致了某种慢性的肠道感染，进而影响到小孩的大脑发育，引发了孤独症。
之后，有研究者在研究了某地在引入这一疫苗前后自闭症儿童数量后，发现并没有很大的变化，也就是说，疫苗的接种并不能导致早期症状的出现。最后，研究还表明，在疫苗接种时间附近并没有出现发展退化的现象。这基本可以排除疫苗与自闭症之间存在因果关系。
目前国际普遍认为的是，自闭症的成因主要是由于特定的基因以及神经解剖异常导致，虽然一般要在三岁左右才能够被确诊，但其实自闭症这种症状更多的可能在孩子还在母体的时候就已经存在，这种基因方面的问题，显然与后天注射的疫苗在世间上存在明显的先后关系，因此很难说疫苗会导致孩子患上自闭症。
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