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1.细菌性腹泻：小儿腹泻有细菌性腹泻，主要是细菌感染。在细菌感染里，最常见的是痢疾
，菌痢，有很强的季节性，此种腹泻一般是在夏季。
菌痢受环境卫生和饮食卫生的影响。特别是在农村和城市的城乡结合地区，这个病的发病率很高。要特别注意集体生活的机构和学校，因为饮食卫生在集体的环境中如果引起广发的话，患病的人数很多。
菌痢主要表现为大便中有脓血，多数病人是发热，同时有乏力，呕吐。菌痢如果经过及时地治疗，大概一周可以彻底治愈。但是菌痢有中毒性痢疾，这个在儿科里属于紧急抢救的疾病，病情比较凶险，可以引起休克和脑水肿。
在细菌性引起的腹泻中，小婴儿中还有沙门氏菌感染（鼠伤寒），这个是在身体抵抗力比较弱的婴幼儿中，发病率很高，治疗难度很大，对许多的抗生素不够敏感，个别病例病情十分凶险。
2. 病毒性腹泻：病毒性腹泻中，比较常见的是轮状病毒的感染，有很强的季节性，一般在秋季和初冬的季节。有很强的年龄倾向，一般在8个月-2岁的婴幼儿中发病很高。特点：水样便，由于受到病毒自限性的影响，病程一般是5-10天，腹泻时间长，很容易造成婴幼儿的脱水，除了轮状病毒外，还有少部分患者由于诺瓦克病毒引起的。
3. 真菌性的腹泻。这种腹泻比以上的两种少，真菌感染，主要以滥用抗生素有关。
另外腹泻从临床上分急性腹泻，迁延性腹泻，慢性腹泻。
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