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（一）农产品物流信息化基础设施匮乏薄弱。在我国农民、农产品聚集地，Intemet网络覆盖区域少，农民上网用户相对较少。在信息化要求下，广大农村地区的联网缺失给农产品物流信息化带来很大的阻碍作用。而分散经营模式下的现状更是加大了政府对基础设施的投资难度，基层政府投资农村网络的能力显得单薄，而绝大部分农户也没有能力承受能力。
（二）农产品物流信息网络断层。当前我国尚未建立起积极有效的统筹协调体系，加之基础设施的不完备使得许多乡镇未能建立自己的信息平台，与外界的网络信息沟通受阻，且基层农业部门的信息发布渠道不完善，未能充分利用媒体的作用促进信息的发布与传播。
（三）农产品物流信息标准化程度低。在我国，广泛应用于其他生产领域的物流信息技术，如RFID、EDI、POS技术等，在农产品领域没有得到充分应用，造成农产品信息采集出现较大问题。而且相对较低的物流信息标准化程度也使农产品产业链的各个环节的信息得不到充分共享，因此降低了农产品物流的效率、未能使其获得规模经济的好处。同时，产业链上信息流通不畅，大大降低了信息的利用率。
（四）信息技术人才缺失。物流信息化建设人才的缺乏是阻碍农产品物流信息化实现的主要原因之一。农产品物流信息化对其工作人员具有较高的要求，不仅要掌握信息分类处理、软件开发、系统维护等信息技术，还要熟识农产品生产流通规律，具备较高的经营实践能力。
（五）政府、公益集团的起步太高。在农产品物流整条产业链上，政府，企业或者是公益集团着力于打造高层次的应用平台的建设，忽略了农民的接受程度，未能建立起有效的信息流通共享机制，导致农业、物流信息资源分散，信息未能全面、准确、及时地发布。
如何做好农产品电商和物流体系建设
农产品电商是目前国内电商领域最具发展前途的“蓝海”，互联网浪潮席卷中国，移动互联网发展如火如荼，而农产品电商发展与其它行业成长关键要素有所不同，强大的冷链配送体系和稳健专业的供应链体系是农产品电商发展的两大关键致胜环节。
一、农产品电商的两大关键致胜环节
不解决“最后一公里”，无冷链不成长
农产品电商的产品需要“全程冷链运输”，从干线冷链到支线冷链、仓储至家等，只有持续的冷链运输才能保证生鲜产品的“新鲜感”，才能保证产品的特色感，消费者才能实现持续的购买。而目前就冷链运输而言，专业化、全程冷链运输远未形成，而且运输成本高。
就全国农产品电商发展的先行地、集中地—“上海”而言，“从生鲜大仓到区域仓库”已经可以实现“冷链运输”，而从“区域冷库”到消费者家中的过程还无法实现“冷链运输”；如果其中运输的还有日用品、饮料等，“分区温度控制”等还远远无法实现，这也是“目前农产品电商”发展的噩梦。
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