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一、新生儿感染性眼病如果感染发生于胚胎发育期，尤其是前三个月，会严重影响眼球的结构，造成重大眼球异常。感染原以梅毒、德国麻疹及艾滋病较常见。生育年龄的妇女能事先加以预防治疗较好。小宝宝出生时，若产道有细菌，如淋菌、披衣菌，会使眼结膜感染而形成新生婴儿眼炎，因此新生婴儿应例行接受预防治疗，若已确定产道有感染，甚至可采取剖腹产，避免产道感染。
二、新生儿遗传性眼病遗传形式，一般分为显性遗传、隐性遗传以及性连遗传三大类。常见的眼疾包括先天性白内障、无虹膜症、视网膜色素变性症等属显性遗传；视网膜胚胎母细胞瘤、部份视网膜色素变性症、白化症等，这些疾病属于隐性遗传；而色盲、脉络膜缺失症则属于性连遗传。
三、新生儿正常结构变异的眼病新生婴儿的视力发展，从出生到二个月大左右，仅能看到模糊的影像，因此对于明亮、鲜艳的物体较感兴趣。
大脑的神经发展，尚不足以稳定控制眼球的运动，因此在这个时期若发现眼睛有内斜视或外斜视的情况，并不一定是异常的现象。
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